Tener el ufs por encima del 100%, suele ser problema de la rotación de logs tanto del sistema como de las aplicaciones instaladas, en mi caso snort, se van creando y creando archivos hasta que llenan nuestro disco duro, para ello se debe de configurar bien tanto en las aplicaciones como en el sistema la rotación y retención de ficheros de log en función del espacio que tenga el HD de pfSense.
Una vez actualizado en status -> system logs -> settings en el apartado rotation, te dice cuanto ocupan los logs actualmente, comprueba que este funcionando bien estando pendiente de esa capacidad, se muestra asi:
Disk space currently used by log files: 38M
Worst case disk usage for base system logs based on current global settings: 58.11 MiB
Remaining disk space for log files: 22G